Отчасти, это связывают с финансовыми нарушениями, связанными с использованием средств бюджета республики на реализацию подпрограммы «Развитие музейного дела на 2014-2020 годы». Немало вопросов вызвала и последняя экспозиция музея, приуроченная к столетию ТАССР.
В настоящее время исполняющей обязанности директора временно является заместитель Назиповой по научно-исследовательской работе Светлана Измайлова до утверждения новой кандидатуры генерального директора.
